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Das ZMT hat Anfang 2011 seine neue, hochmoderne experimentelle Meerwasseraquarienanlage MAREE (MARine Experimental Ecology) in Betrieb genommen. Herzstück von MAREE ist ein 15 Kubikmeter großes, betauchbares Hälterungsbecken, mit dessen Hilfe die Wissenschaftler des ZMT ein Korallenriff naturnah nachbilden werden.

Ein solcher Mesokosmos mit seiner Ausstattung und Technik ist einzigartig für ein Forschungsinstitut in Deutschland und wird dem ZMT die Durchführung einer Reihe von experimentellen Studien ermöglichen, die es in dieser Form bisher nicht gab. MAREE besitzt darüber hinaus fünf unabhängige Wasserkreisläufe und insgesamt mehr als 60 Hälterungsaquarien für die Durchführung von wissenschaftlichen Experimenten. Die Anlage ist so ausgerüstet, dass eine Reihe von Umweltbedingungen wie Temperatur, Nährstoff- und Lichtverfügbarkeit sowie der Säuregehalt und die Wasserströmung variiert werden können.

MAREE wird die Wissenschaftler am ZMT mit diesen neuen Möglichkeiten dabei unterstützen, zusätzlich zu den Feldstudien in Entwicklungsländern ergänzende Laborexperimente unter kontrollierten Bedingungen durchzuführen. Darüber hinaus sollen ökophysiologische Experimente unternommen werden, um den Stoffwechsel von Meerestieren in Bezug auf Umweltveränderungen zu verstehen. Ein wichtiger MAREE-Forschungsbereich wird auch die wissenschaftliche Optimierung der Nachzucht von wirtschaftlich und ökologisch wichtigen Meeresorganismen (z.B. Anemonenfische, Seeigel, Korallen) sein.